組織病理學中的原始解析度互動式三維視覺化 (Interactive Visualization of 3D Histopathology in...

摘要： 迄今為止，基於病理學的臨床工作流程和研究主要由2D成像主導，目前在組織病理學中缺乏適當的視覺化工具，這已成為數字病理學的一個限制因素。 3D組織學全色資料集密集且規模大，大約100,000×100,000×100個體素，這對渲染效能和使用者體驗設計提出了嚴格的要求。本文提出了一種視覺化應用程式...

迄今為止，基於病理學的臨床工作流程和研究主要由2D成像主導，目前在組織病理學中缺乏適當的視覺化工具，這已成為數字病理學的一個限制因素。 3D組織學全色資料集密集且規模大，大約100,000×100,000×100個體素，這對渲染效能和使用者體驗設計提出了嚴格的要求。本文提出了一種視覺化應用程式，可以對大規模3D組織病理學進行有效的互動式視覺化分析，即人體組織的高解析度3D顯微鏡資料。該應用程式基於對現有方法的定製和調整，系統整合工作，以及對領域專家作為團隊成員的密切參與式設計過程產生的領域特定需求的仔細研究。

軟體的使用者介面如圖所示，左上角為相機控制；左下角包括一些基本選項，例如顯示/去除背景等；右上角為小地圖，提供總覽以及位置資訊；下方包括三種模式，分別將操作模式限制為相機放大縮小控制、檢視平移、剪切面沿法線平移。

整個渲染的流程如下：

整個工作中沒有很大的改進或是創新，他們利用對現有方法的改進與結合，很好地解決了這個問題。體繪製中的傳統檢視和互動不適合非常大且密集的組織學資料。例如，在視錐體的近平面處的剪下導致近檢視中的迷失方向。子體積場景解決方案有效地解決了這個問題。

參考文獻

[1] Falk, Martin, et al. “Interactive Visualization of 3D Histopathology in Native Resolution.” IEEE transactions on visualization and computer graphics (2018).