志諾維思出席2018中國大資料技術大會
2018年12月7日,由中國計算機學會主辦,CCF大資料專家委員會承辦的2018中國大資料技術大會(BDTC)在北京盛大召開。志諾維思(北京)基因科技有限公司生物資訊科技總監郝伶童出席大會並發表題為:“人工智慧技術在基因組學和病理學兩大領域助力腫瘤免疫治療”的主題演講。
會上,郝伶童首先對目前國內外腫瘤免疫治療的進展進行了回顧。他表示未來五年,以免疫治療為中心的腫瘤治療方法將呈現出高速增長的態勢。但不是所有腫瘤患者都適用於免疫治療,免疫檢查點抑制劑目前有效率大約在30%左右,若能治療前能夠對患者是否適合免疫治療進行預判,從衛生經濟學的角度將從整體上降低患者經濟負擔方面。腫瘤精準免疫治療對,腫瘤基因組和病理檢測提出了更高的定量分析要求。例如,PD-L1及免疫微環境生物標記物(Tumor Immunological MicroEnvironment:TIME)的陽性定量、腫瘤突變負荷(Tumor Mutation Burden, TMB)對於藥物的獲益基線,及微衛星不穩定狀態(Microsatellite Instability, MSI)的定量判讀是目前腫瘤精準診療大資料分析中的關鍵熱點問題。
隨後,郝伶童重點介紹了志諾維思自主研發的基於人工智慧的基因組和病理分析的演算法:首先他介紹了快速智慧變異探測演算法——Genome Variant Caller(GVC),能夠實現極速的腫瘤變異負載(TMB)的精準定量,並能結合療效資料對TMB和MSI等多指標基線進行劃定。之後,他介紹公司專門針對目前免疫治療的病理分析需求,開發出的一套基於深度學習技術對免疫組化影象中的PD-L1及相關免疫治療標誌物進行綜合定量的演算法——Immunology Biomarker Analyzer (IOBA),該演算法能實現基於連續切片的免疫微環境(TIME)定量分析。
在重點介紹完演算法後,他表示志諾維思正在基於核心演算法搭建的雲產品體系。該體系將面向腫瘤精準醫療,在生物資訊學分析、病理圖文分析、醫學解讀和組學大資料分析與管理等多個受限環節上,對第三方檢測機構和醫院進行全面賦能。”“目前志諾維思搭建的抗癌登月大資料平臺已經與國內83家三甲醫院開展腫瘤大資料多中心研究專案,正在對33個癌種的病理報告進行結構化分析,幫助抗癌協會建立癌症診斷水準和規範化程度評估體系、為制定下一代癌症診斷指南奠定基礎。”
大會現場